Die Bezirksregierung Münster ist für die Entwicklung, die Unterhaltung und den naturnahen Ausbau der Ems im landeseigenen Abschnitt zwischen Warendorf und Rheine verantwortlich. Das Ziel ist es, den Fluss und seine Aue als natürlichen Lebensraum zu erhalten und zu reaktivieren. Dabei sind der ordnungsgemäße Wasserabfluss und der Hochwasserschutz in der Entwicklung der Ems zu berücksichtigen.

Gemäß § 25 des Wasserhaushaltsgesetzes (WHG) darf jede Person oberirdische Gewässer (insbesondere Flüsse und Seen) in einer Weise und in einem Umfang benutzen, wie sie das Landesrecht zulässt und soweit nicht Rechte anderer entgegenstehen bzw. beeinträchtigt werden. Die für Nordrhein-Westfalen maßgebende Regelung findet sich in § 19 Landeswassergesetz NRW (LWG NRW).

Die Bezirksregierung Münster ist Ansprechpartnerin für die Bereiche Wasserwirtschaft und Gewässerschutz. Als Obere Wasserbehörde ist sie für wasserrechtliche Genehmigungen und für die Überwachung der Gewässer zuständig. 

Bemessungsabflüsse sind Abschätzungen von Abflussgrößen, die die Bezirksregierung Münster für den Regierungs­bezirk ermittelt. Die Daten bilden die Grundlage für die wasserwirtschaftliche Arbeit der Behörde. Auf Anfrage stellt die Bezirksregierung Münster die Bemessungs­abflüsse für wasserwirtschaftliche Planungen im Dienstbezirk zur Verfügung.

Die Wasser- und Bodenverbände nehmen im öffentlichen Interesse und zum Nutzen ihrer Mitglieder diverse Aufgaben der Wasserwirtschaft wahr.