Die Bezirksregierung Münster führt medienübergreifende Umweltinspektionen für Industrieanlagen mit besonders hohem Umweltrisiko, die der Verordnung über genehmigungsbedürftige Anlagen (4. BImSchV) unterliegen, durch. Außerdem werden wasserwirtschaftliche Anlagen, unter anderem Kläranlagen und Wasserwerke, sowie Deponien regelmäßig überwacht. Insgesamt überwacht die Bezirksregierung circa 1.200 Anlagen. Für alle anderen Anlagen sind die unteren Umweltschutzbehörden der fünf Kreise und drei kreisfreien Städte zuständig.